More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1873 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1873  DnaB domain-containing protein  100 
 
 		 465 aa  925    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  39.96 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3562  DnaB domain protein helicase domain protein  39.48 
 
 		 479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  39.96 
 
 		 495 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  39.96 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4095  DnaB domain-containing protein  40.38 
 
 		 482 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  40.04 
 
 		 495 aa  279  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  38.91 
 
 		 495 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  39.03 
 
 		 495 aa  273  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  38.12 
 
 		 497 aa  269  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  39.15 
 
 		 498 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 498 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  37.95 
 
 		 498 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  38.03 
 
 		 498 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  37.95 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  38.04 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  36.51 
 
 		 496 aa  256  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  36.21 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6270  DnaB domain protein helicase domain protein  37.69 
 
 		 486 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  37.32 
 
 		 501 aa  253  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  36.02 
 
 		 500 aa  253  7e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  37.76 
 
 		 497 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  36.7 
 
 		 501 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  39.45 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  36.7 
 
 		 501 aa  250  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  38.92 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  36.36 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6988  DnaB domain protein helicase domain protein  37.01 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  36.42 
 
 		 499 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  36.36 
 
 		 498 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 498 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  33.2 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  38 
 
 		 443 aa  234  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  35.92 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  35.92 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  35.92 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  35.92 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  35.92 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  36.14 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  35.92 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  35.86 
 
 		 504 aa  231  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  35.82 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  37.84 
 
 		 496 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  36.83 
 
 		 494 aa  230  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  37.84 
 
 		 496 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  37.84 
 
 		 496 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  36.11 
 
 		 499 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  35.48 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  35.48 
 
 		 453 aa  229  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  35.29 
 
 		 504 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  35.11 
 
 		 505 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  36.76 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  38.34 
 
 		 442 aa  224  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  35.5 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  36 
 
 		 494 aa  223  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  31.55 
 
 		 483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  36.22 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  35.79 
 
 		 453 aa  216  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  35.56 
 
 		 454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  35.16 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  35.12 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  34.91 
 
 		 457 aa  213  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  34.91 
 
 		 457 aa  213  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  33.48 
 
 		 443 aa  213  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  35.31 
 
 		 463 aa  212  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  34.15 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  35.88 
 
 		 441 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  35.42 
 
 		 451 aa  210  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1232  replicative DNA helicase  37.09 
 
 		 452 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.323473  normal  0.298764 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  31.16 
 
 		 442 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  35.89 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  35.7 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  33.97 
 
 		 466 aa  206  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  31.87 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  36.7 
 
 		 450 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  31.45 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  32.17 
 
 		 446 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  37.34 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1111  replicative DNA helicase  31.14 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.229668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  33.19 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  33.19 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0739  replicative DNA helicase  32 
 
 		 463 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  34.21 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  33.33 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  33.33 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0832  replicative DNA helicase  30.91 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0840  replicative DNA helicase  30.63 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.337638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  33.78 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  36.54 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  33.11 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  34.3 
 
 		 454 aa  200  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  34.23 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1024  replicative DNA helicase  30.68 
 
 		 428 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.916130000000001e-26 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  35.9 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1028  replicative DNA helicase  31.75 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  30.92 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  34.21 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0535  replicative DNA helicase  31.22 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  34.57 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  33.63 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>