121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0227 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  100 
 
 
532 aa  1092    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  54.3 
 
 
539 aa  608  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  55 
 
 
540 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  54.29 
 
 
532 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  54.77 
 
 
535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  53.13 
 
 
548 aa  589  1e-167  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  49.52 
 
 
530 aa  550  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  49.24 
 
 
538 aa  541  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  50.76 
 
 
531 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  49.81 
 
 
539 aa  535  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  48.67 
 
 
546 aa  531  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  49.91 
 
 
537 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  30.94 
 
 
522 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  22.39 
 
 
499 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  23.23 
 
 
493 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  23.34 
 
 
498 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  22.17 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  23.37 
 
 
498 aa  73.9  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  22.03 
 
 
495 aa  73.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  21.77 
 
 
500 aa  70.5  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.13 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  22.51 
 
 
496 aa  67  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  21.71 
 
 
505 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0437  carbohydrate kinase FGGY  22.63 
 
 
498 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000361421  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  21.84 
 
 
510 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  23.2 
 
 
501 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  23.44 
 
 
486 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  23.44 
 
 
486 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  23.44 
 
 
486 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  25.97 
 
 
486 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  22.8 
 
 
509 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  23.27 
 
 
475 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  22.37 
 
 
502 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  23.27 
 
 
475 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  23.27 
 
 
475 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  23.27 
 
 
475 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  21.81 
 
 
496 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  23.63 
 
 
491 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  24.58 
 
 
481 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  23.85 
 
 
499 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  22.15 
 
 
493 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  22.54 
 
 
484 aa  57  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  20.48 
 
 
496 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  21.31 
 
 
512 aa  54.7  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  23.81 
 
 
486 aa  54.7  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.18 
 
 
489 aa  54.3  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  22.15 
 
 
486 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  23.38 
 
 
488 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  21.67 
 
 
502 aa  54.3  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  22.33 
 
 
497 aa  53.9  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  22.89 
 
 
488 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  22.89 
 
 
488 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  23.45 
 
 
493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  22.15 
 
 
465 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  23.45 
 
 
493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  23.79 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  23.79 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  23.25 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  23.79 
 
 
493 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  22.89 
 
 
488 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  23.22 
 
 
509 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  22.15 
 
 
496 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  22.61 
 
 
485 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  25.31 
 
 
475 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0409  glycerol kinase  24.6 
 
 
481 aa  50.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  25.12 
 
 
481 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  23.15 
 
 
485 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  23.05 
 
 
515 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  22.56 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  21.18 
 
 
487 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  22.49 
 
 
493 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  22.56 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  22.56 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  22.56 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  23.15 
 
 
485 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  21.18 
 
 
494 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  21.68 
 
 
506 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  23.76 
 
 
463 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  23.1 
 
 
493 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  23.65 
 
 
492 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  23.65 
 
 
492 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  21.23 
 
 
488 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  20.45 
 
 
518 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  23.15 
 
 
492 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  23.15 
 
 
492 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  22.65 
 
 
458 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  23.27 
 
 
484 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  21.74 
 
 
492 aa  47.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  27.74 
 
 
526 aa  47  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  21.3 
 
 
483 aa  47  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  23.15 
 
 
492 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  23.31 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  22.39 
 
 
511 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  21.24 
 
 
485 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  20.82 
 
 
509 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1235  xylulokinase  23.69 
 
 
480 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.757817  normal  0.113808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  22.8 
 
 
484 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  23.08 
 
 
486 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  21.32 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  23.59 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>