More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42527 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  100 
 
 
522 aa  1078    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  30.94 
 
 
532 aa  189  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  28.97 
 
 
532 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  28.63 
 
 
540 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  29.03 
 
 
535 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  31.2 
 
 
548 aa  181  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  28.78 
 
 
539 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  28.86 
 
 
539 aa  168  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  27.72 
 
 
530 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  28.73 
 
 
546 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.38 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28 
 
 
538 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  29.53 
 
 
496 aa  160  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  25.96 
 
 
510 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  33.08 
 
 
537 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.1 
 
 
489 aa  153  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  26.58 
 
 
500 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  30.48 
 
 
502 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  30.26 
 
 
496 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.05 
 
 
512 aa  146  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  29.5 
 
 
499 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  29.19 
 
 
495 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  28.76 
 
 
493 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  28.79 
 
 
493 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  29.05 
 
 
496 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  28.1 
 
 
498 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  26.37 
 
 
505 aa  136  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  27.29 
 
 
497 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  26.83 
 
 
498 aa  130  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  25.24 
 
 
509 aa  130  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  27.1 
 
 
511 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  25.47 
 
 
502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  27.57 
 
 
518 aa  127  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  24.95 
 
 
490 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  26.11 
 
 
498 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.85 
 
 
501 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  26.67 
 
 
515 aa  124  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.67 
 
 
504 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.27 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.37 
 
 
506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  26.91 
 
 
505 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.74 
 
 
511 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  24.86 
 
 
496 aa  117  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25.11 
 
 
509 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  26.11 
 
 
498 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  26.28 
 
 
484 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.33 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.19 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.33 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1605  carbohydrate kinase FGGY  27.69 
 
 
490 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  25.38 
 
 
484 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  25.38 
 
 
484 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  25.38 
 
 
484 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  25.38 
 
 
484 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  27.72 
 
 
495 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  27.31 
 
 
491 aa  110  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  26.58 
 
 
485 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  24.32 
 
 
492 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  25.19 
 
 
484 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  25.48 
 
 
488 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  24.61 
 
 
492 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  25.19 
 
 
484 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  25 
 
 
484 aa  107  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  27.11 
 
 
486 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  24.76 
 
 
484 aa  106  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  23.65 
 
 
499 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  25.22 
 
 
488 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  25.6 
 
 
483 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  25.99 
 
 
511 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  26.09 
 
 
486 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  26.55 
 
 
492 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  26.34 
 
 
492 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  26.89 
 
 
486 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  26.89 
 
 
486 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  26.89 
 
 
486 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  23.99 
 
 
482 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  26.09 
 
 
517 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  24.57 
 
 
484 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  26.36 
 
 
492 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  26.09 
 
 
517 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  26.15 
 
 
492 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  26.36 
 
 
492 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  27.13 
 
 
469 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  26.44 
 
 
475 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  26.44 
 
 
475 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  25.76 
 
 
492 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  26.44 
 
 
475 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  26.44 
 
 
475 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  28.41 
 
 
472 aa  101  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  24.46 
 
 
530 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  25.48 
 
 
485 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  26.64 
 
 
487 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  24.18 
 
 
484 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  23.65 
 
 
489 aa  100  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  26.07 
 
 
494 aa  100  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  28.24 
 
 
533 aa  99.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  22.41 
 
 
497 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  26.29 
 
 
487 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  27.45 
 
 
475 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  26.64 
 
 
478 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>