187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29500 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  100 
 
 		 546 aa  1080    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  59.43 
 
 		 538 aa  591  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  50.47 
 
 		 540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  56.3 
 
 		 531 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  49.24 
 
 		 532 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  54.1 
 
 		 539 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  47.92 
 
 		 535 aa  535  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  55.92 
 
 		 537 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  48.67 
 
 		 532 aa  531  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  50.56 
 
 		 548 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  46.12 
 
 		 539 aa  497  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  45.71 
 
 		 530 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  28.73 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  25.99 
 
 		 510 aa  93.6  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  24.73 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  25 
 
 		 493 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  27.53 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  24.67 
 
 		 493 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  27.53 
 
 		 496 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.67 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  24.95 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  21.34 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  24.78 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.8 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  24.9 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.48 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  22.51 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  24.29 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  25 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  20.76 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  26.93 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  25.32 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  23.14 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  26.6 
 
 		 505 aa  67  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  23.69 
 
 		 497 aa  66.6  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  24.69 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  24.44 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  24.16 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  25.38 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  24.62 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  22.41 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  23.68 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  22.33 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  24.5 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  25.11 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  24.5 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  23.98 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  24.5 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  24.29 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  27.18 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  24.29 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  27.86 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  28.16 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  21.68 
 
 		 503 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  24.29 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  24.29 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  24.48 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  24.58 
 
 		 489 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  25.86 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0437  carbohydrate kinase FGGY  24.62 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000361421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  21.85 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  22.85 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  28.16 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  28.16 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  23.51 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  24.51 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  23.4 
 
 		 499 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  27.67 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  27.67 
 
 		 492 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  24.5 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  26.09 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  26.21 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  25 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  22.43 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  24.62 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  23.64 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  26.35 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  25.39 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  24.88 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  24.77 
 
 		 517 aa  57  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  23.33 
 
 		 511 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  27.42 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  21.52 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  25.77 
 
 		 485 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  24.17 
 
 		 517 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  25.38 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  25.89 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  27.78 
 
 		 485 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  24.51 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1928  carbohydrate kinase FGGY  24.26 
 
 		 493 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00371914  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  27.53 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  23.16 
 
 		 499 aa  55.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  24.51 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  24.51 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  23.95 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  23.08 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  25.13 
 
 		 501 aa  55.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  26.67 
 
 		 484 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  24.47 
 
 		 484 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>