More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0409 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0409  glycerol kinase  100 
 
 		 481 aa  986    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  52.86 
 
 		 496 aa  523  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  51.63 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  52.44 
 
 		 494 aa  507  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  48.87 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  48.66 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  48.66 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  47.73 
 
 		 496 aa  478  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  51.14 
 
 		 479 aa  480  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  48.45 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  48.27 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  48.27 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  48.27 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  48.27 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  49.59 
 
 		 500 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  48.25 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  48.16 
 
 		 498 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  48.27 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  48.27 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  48.27 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  48.27 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  47.25 
 
 		 502 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  47.31 
 
 		 496 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  47.52 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  47.52 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  47.25 
 
 		 502 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  47.86 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  47.25 
 
 		 502 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  47.31 
 
 		 496 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  47.84 
 
 		 501 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  47.25 
 
 		 502 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  48.27 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  48.07 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  48.27 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  47.86 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  47.52 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  47.25 
 
 		 502 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  47.67 
 
 		 507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  47.31 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  48.47 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  48.07 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  47.31 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  50 
 
 		 489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  48.68 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  47.31 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  49.28 
 
 		 498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  49.28 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  48.36 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  47.25 
 
 		 502 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  47.05 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  49.49 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  48.07 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  48.47 
 
 		 498 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  47.45 
 
 		 503 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08090  glycerol kinase  48.16 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000058898  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0041  glycerol kinase  48.06 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.684813  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  47.86 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  48.47 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  48.26 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  46.49 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  47.25 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  47.03 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  47.05 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  47.11 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  47.24 
 
 		 505 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  47.25 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  47.25 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  47.44 
 
 		 500 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  47.44 
 
 		 500 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  47.44 
 
 		 500 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  47.76 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  47.95 
 
 		 496 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  47.11 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  47.25 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  47.44 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  47.44 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  48.11 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  46.93 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  47.44 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  47.44 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  49.49 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  47.24 
 
 		 497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  47.03 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  48.66 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  46.72 
 
 		 495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  47.44 
 
 		 496 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  48.57 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  47.14 
 
 		 505 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  46.82 
 
 		 495 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  45.92 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  46 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  46.63 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  46.53 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  46.42 
 
 		 520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2595  glycerol kinase  46.03 
 
 		 498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  46.63 
 
 		 518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  45.77 
 
 		 504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  46.63 
 
 		 518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  46.63 
 
 		 518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  46.63 
 
 		 518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>