207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1582 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1582  nuclease  100 
 
 		 483 aa  963    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4797  nuclease  58.5 
 
 		 531 aa  494  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2259  nuclease  61.08 
 
 		 526 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4642  parB-like partition protein  34.3 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1320  nuclease  31.14 
 
 		 516 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4332  ParB family protein  32.52 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5536  nuclease  31.19 
 
 		 546 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021516  hitchhiker  0.0000306668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0940  hypothetical protein  29.47 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9009  ParB domain protein nuclease  26.71 
 
 		 575 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.133491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  27.87 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  39.02 
 
 		 298 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  39.73 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  34.11 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  28.32 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  32.23 
 
 		 285 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  29.24 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  28.92 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  30.32 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  27.13 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  28.92 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  30.67 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  28.92 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  38.1 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  32.41 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  30.57 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  31.54 
 
 		 318 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  29.86 
 
 		 314 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  41.38 
 
 		 293 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  32.21 
 
 		 321 aa  53.9  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  30 
 
 		 329 aa  53.9  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32.62 
 
 		 274 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  26.55 
 
 		 312 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3186  parB-like partition protein  30.82 
 
 		 350 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000842796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  32.89 
 
 		 317 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  28.41 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  29.2 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  28.39 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  31.33 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  30.26 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  32.46 
 
 		 261 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  33.61 
 
 		 378 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  35.19 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  27.48 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5811  parB-like partition protein  34.06 
 
 		 299 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  27.64 
 
 		 292 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  32.46 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 298 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  28.3 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  39.24 
 
 		 290 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  29.33 
 
 		 335 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 298 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1719  parB family protein  30.43 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0272  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1410  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.156859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  28.26 
 
 		 293 aa  50.8  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  30.82 
 
 		 309 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  34.12 
 
 		 283 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  29.37 
 
 		 304 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  29.14 
 
 		 299 aa  50.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  29.14 
 
 		 299 aa  50.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  30.23 
 
 		 305 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  33.12 
 
 		 298 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  26.55 
 
 		 296 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  33.64 
 
 		 367 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 269 aa  50.1  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0021  ParB family protein  42.7 
 
 		 320 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  25.42 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  27.78 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1094  parB-like partition proteins  46.03 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0765173  hitchhiker  0.00022246 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  30.77 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0177  parB-like partition protein  30.15 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000490694  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  37.68 
 
 		 281 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  36.67 
 
 		 296 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  26.83 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  37.97 
 
 		 290 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 290 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  35.62 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  36.23 
 
 		 289 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  26.36 
 
 		 295 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  35.71 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  31.9 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  34.18 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  34.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  30.97 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  34.88 
 
 		 286 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 290 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  28.76 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  23.97 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  27.14 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  34.18 
 
 		 292 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  29.77 
 
 		 295 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  34.12 
 
 		 297 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 290 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  32.48 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  27.64 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  23.38 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>