209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1320 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1320  nuclease  100 
 
 		 516 aa  1023    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1582  nuclease  30.32 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5536  nuclease  33.46 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021516  hitchhiker  0.0000306668 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4797  nuclease  29.37 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4642  parB-like partition protein  39.65 
 
 		 451 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4332  ParB family protein  40 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0940  hypothetical protein  27.48 
 
 		 590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9009  ParB domain protein nuclease  26.73 
 
 		 575 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.133491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2259  nuclease  36.24 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  29.73 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  30.77 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  35.34 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3729  plasmid partitioning protein  32.62 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183946  normal  0.190659 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  40.52 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  32.58 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  34.62 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  27.92 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  33.88 
 
 		 278 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  31.16 
 
 		 272 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  35.1 
 
 		 298 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  42.24 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 261 aa  55.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  30.64 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.6 
 
 		 299 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  35.77 
 
 		 314 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  34.04 
 
 		 571 aa  54.3  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  29.83 
 
 		 289 aa  54.3  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  35 
 
 		 279 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  30.59 
 
 		 367 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  33.1 
 
 		 317 aa  54.3  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  32.57 
 
 		 309 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  32.5 
 
 		 279 aa  53.5  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  34.65 
 
 		 379 aa  53.5  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  38.83 
 
 		 362 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  32.5 
 
 		 279 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  33.08 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  31.62 
 
 		 289 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  32.05 
 
 		 288 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  34.51 
 
 		 286 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  29.08 
 
 		 280 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  29.75 
 
 		 279 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  29.63 
 
 		 274 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  27.68 
 
 		 280 aa  51.6  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  25.42 
 
 		 269 aa  52  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  32.76 
 
 		 285 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  30 
 
 		 282 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  29.85 
 
 		 297 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  26.6 
 
 		 283 aa  51.2  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  30.95 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  35.71 
 
 		 422 aa  51.6  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  36.07 
 
 		 301 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  30.54 
 
 		 298 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  33.06 
 
 		 318 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  25.27 
 
 		 283 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  31.18 
 
 		 293 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  31.78 
 
 		 256 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  30.56 
 
 		 280 aa  50.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  31.34 
 
 		 662 aa  50.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  30.16 
 
 		 293 aa  50.8  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  32.23 
 
 		 321 aa  50.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  36.07 
 
 		 296 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  32.76 
 
 		 367 aa  50.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  31.18 
 
 		 296 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  31.78 
 
 		 283 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  31.78 
 
 		 283 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  29.79 
 
 		 557 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 280 aa  50.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  32.62 
 
 		 596 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  31.74 
 
 		 294 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  32.08 
 
 		 283 aa  50.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  33.85 
 
 		 281 aa  50.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  24.73 
 
 		 283 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  34.13 
 
 		 292 aa  50.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  31.78 
 
 		 283 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  33.59 
 
 		 284 aa  50.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30 
 
 		 662 aa  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 284 aa  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  33.52 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  27.66 
 
 		 612 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  33.54 
 
 		 319 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  29.63 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  29.3 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  33.6 
 
 		 289 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  29.21 
 
 		 283 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  37.37 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  34.34 
 
 		 268 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  31.77 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  31.13 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  30.89 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  26.59 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  30.28 
 
 		 559 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  35.34 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  29.8 
 
 		 297 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  32.85 
 
 		 284 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  31.79 
 
 		 298 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  29.79 
 
 		 579 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  31.13 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>