69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2259 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2259  nuclease  100 
 
 		 526 aa  1053    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4797  nuclease  73.66 
 
 		 531 aa  679    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1582  nuclease  62.32 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4642  parB-like partition protein  34.07 
 
 		 451 aa  193  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1320  nuclease  29.08 
 
 		 516 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4332  ParB family protein  32.24 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5536  nuclease  29.42 
 
 		 546 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021516  hitchhiker  0.0000306668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0940  hypothetical protein  26.06 
 
 		 590 aa  85.9  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  30.35 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  35.34 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  38 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  39.39 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  30.23 
 
 		 298 aa  56.6  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  33.11 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  31.13 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9009  ParB domain protein nuclease  23.65 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.133491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  33.9 
 
 		 529 aa  53.9  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1719  parB family protein  29.57 
 
 		 417 aa  53.9  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  29.69 
 
 		 296 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  34.82 
 
 		 358 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  25.74 
 
 		 295 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  26.9 
 
 		 615 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  31.62 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  28.87 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  30.32 
 
 		 344 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  29.31 
 
 		 292 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0272  parB-like partition protein  28.7 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  30.67 
 
 		 330 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  30.67 
 
 		 330 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  30.67 
 
 		 330 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  29.36 
 
 		 303 aa  50.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1410  parB-like partition protein  28.7 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.156859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  30.17 
 
 		 298 aa  50.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 294 aa  50.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  32.52 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  27.14 
 
 		 591 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  27.5 
 
 		 280 aa  48.9  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  30.17 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  27.98 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  33.04 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  29.63 
 
 		 268 aa  47.8  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  27.98 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  27.27 
 
 		 312 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  29.14 
 
 		 335 aa  47  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  30.61 
 
 		 312 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  29.41 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  28.57 
 
 		 312 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  31.36 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  28.68 
 
 		 293 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  28.66 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  33.03 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1094  parB-like partition proteins  41.33 
 
 		 321 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0765173  hitchhiker  0.00022246 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  28.7 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  32.61 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  32.61 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  28.85 
 
 		 331 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  29.68 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  29.51 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  30.07 
 
 		 323 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  30.08 
 
 		 269 aa  44.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  25.86 
 
 		 297 aa  44.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  23.12 
 
 		 294 aa  44.3  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  29.41 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  28.21 
 
 		 391 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  30.46 
 
 		 298 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>