213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5536 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5536  nuclease  100 
 
 
546 aa  1096    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021516  hitchhiker  0.0000306668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1320  nuclease  33.09 
 
 
516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4642  parB-like partition protein  31.25 
 
 
451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4332  ParB family protein  29.92 
 
 
451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4797  nuclease  30.36 
 
 
531 aa  146  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1582  nuclease  31.44 
 
 
483 aa  140  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2259  nuclease  36.22 
 
 
526 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9009  ParB domain protein nuclease  31.23 
 
 
575 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.133491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0940  hypothetical protein  26.77 
 
 
590 aa  83.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  28.85 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  27.59 
 
 
283 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  27.16 
 
 
283 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  34.9 
 
 
281 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  28.78 
 
 
283 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  28.78 
 
 
283 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  28.37 
 
 
256 aa  65.1  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  28.78 
 
 
283 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  28.37 
 
 
256 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  27.4 
 
 
283 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  27.4 
 
 
283 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  29.52 
 
 
274 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  36.89 
 
 
311 aa  60.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  25.4 
 
 
283 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  31.9 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  33.33 
 
 
422 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  38.95 
 
 
288 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  34.21 
 
 
314 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  35.59 
 
 
298 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  34.52 
 
 
314 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  27.4 
 
 
477 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  26.92 
 
 
272 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  27.14 
 
 
273 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  33.63 
 
 
279 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  27.54 
 
 
283 aa  53.9  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  32.48 
 
 
367 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  35.34 
 
 
299 aa  53.5  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  36.61 
 
 
288 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.33 
 
 
323 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  31.41 
 
 
286 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  36.27 
 
 
311 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  33.33 
 
 
363 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  35.77 
 
 
355 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  36.73 
 
 
296 aa  52  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  26.95 
 
 
285 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  33.86 
 
 
286 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  27.63 
 
 
280 aa  51.2  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  24.02 
 
 
352 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  33.9 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  32.29 
 
 
297 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0177  parB-like partition protein  32.46 
 
 
350 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000490694  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  30.39 
 
 
284 aa  51.2  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  27.72 
 
 
298 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  31.79 
 
 
309 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  36.94 
 
 
305 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  33.93 
 
 
281 aa  50.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  30.37 
 
 
282 aa  50.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  31.82 
 
 
298 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  31.82 
 
 
298 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  27.81 
 
 
280 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  33.04 
 
 
379 aa  50.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  34.82 
 
 
317 aa  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  28.99 
 
 
286 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  33.86 
 
 
313 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  34.74 
 
 
597 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  34.41 
 
 
309 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  34.81 
 
 
302 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  36.36 
 
 
289 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2543  parB-like partition protein  33.93 
 
 
358 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  37.89 
 
 
293 aa  49.7  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  34.21 
 
 
668 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  30.36 
 
 
318 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  37.89 
 
 
293 aa  49.7  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  35.04 
 
 
529 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  33.05 
 
 
297 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  27.66 
 
 
281 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  29.17 
 
 
261 aa  48.5  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  32.14 
 
 
307 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  26.7 
 
 
305 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2980  ParB-like chromosome partitioning protein  39.74 
 
 
305 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  26.49 
 
 
292 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  31.37 
 
 
293 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  30.91 
 
 
344 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  30.09 
 
 
401 aa  48.5  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  37.89 
 
 
293 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  33.05 
 
 
305 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  27.85 
 
 
303 aa  48.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  29.09 
 
 
283 aa  48.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  32.05 
 
 
304 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  33.05 
 
 
297 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  34.45 
 
 
284 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  25.21 
 
 
290 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  33.05 
 
 
305 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  32.2 
 
 
295 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  33.05 
 
 
297 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  25.21 
 
 
290 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  33.05 
 
 
305 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  33.05 
 
 
297 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  32.2 
 
 
311 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  34.31 
 
 
383 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  29.35 
 
 
305 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>