38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0940 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0940  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1182    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9009  ParB domain protein nuclease  36.44 
 
 		 575 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.133491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1320  nuclease  27.48 
 
 		 516 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1582  nuclease  28.28 
 
 		 483 aa  91.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4642  parB-like partition protein  26.11 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4332  ParB family protein  27.54 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5536  nuclease  30.47 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021516  hitchhiker  0.0000306668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  31.21 
 
 		 295 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2259  nuclease  32.5 
 
 		 526 aa  57  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  32.53 
 
 		 286 aa  54.7  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4797  nuclease  29.7 
 
 		 531 aa  53.9  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  28.22 
 
 		 268 aa  53.5  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  34.9 
 
 		 304 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  28.85 
 
 		 292 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  40.85 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3306  parB-like partition protein  25.99 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  32.97 
 
 		 290 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  27.43 
 
 		 283 aa  48.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  31.54 
 
 		 291 aa  47.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  29.01 
 
 		 284 aa  47.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  30.15 
 
 		 293 aa  47  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  39.24 
 
 		 367 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  28.3 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 281 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  28.91 
 
 		 322 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  28.3 
 
 		 290 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  31.69 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  30.06 
 
 		 292 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  27.49 
 
 		 290 aa  44.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3738  parB-like partition proteins  29.1 
 
 		 305 aa  44.3  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.412058 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  30 
 
 		 293 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  36.64 
 
 		 288 aa  43.9  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  28.3 
 
 		 294 aa  43.9  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  32 
 
 		 409 aa  43.9  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  30.53 
 
 		 296 aa  43.9  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  36.64 
 
 		 290 aa  43.9  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2543  parB-like partition protein  29.58 
 
 		 358 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.0207882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>