88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4797 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2259  nuclease  72.52 
 
 		 526 aa  646    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4797  nuclease  100 
 
 		 531 aa  1067    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1582  nuclease  60 
 
 		 483 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4332  ParB family protein  31.55 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4642  parB-like partition protein  31.68 
 
 		 451 aa  179  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1320  nuclease  29.5 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5536  nuclease  32.05 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021516  hitchhiker  0.0000306668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0940  hypothetical protein  24.65 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  29.95 
 
 		 477 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  33.74 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  32.61 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  39 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  40.4 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  42.25 
 
 		 273 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  30.23 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  34.75 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  31.79 
 
 		 318 aa  57  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  36.28 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  30.28 
 
 		 303 aa  54.7  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  31.03 
 
 		 298 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  28.91 
 
 		 296 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1719  parB family protein  30.43 
 
 		 417 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  31.14 
 
 		 314 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  30.46 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  29.31 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  30.11 
 
 		 344 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  31.74 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  32.5 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  31.74 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  31.74 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  29.09 
 
 		 312 aa  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  30.56 
 
 		 564 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  29.41 
 
 		 293 aa  51.6  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  33.04 
 
 		 379 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0272  parB-like partition protein  29.57 
 
 		 412 aa  51.2  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1410  parB-like partition protein  29.57 
 
 		 412 aa  51.2  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.156859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  34 
 
 		 350 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  24.51 
 
 		 295 aa  51.2  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  33.62 
 
 		 331 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  31.55 
 
 		 391 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  29.09 
 
 		 591 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  31.3 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  30.18 
 
 		 334 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9009  ParB domain protein nuclease  22.66 
 
 		 575 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.133491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  25.86 
 
 		 297 aa  47.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  31.71 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  30.36 
 
 		 331 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  29.94 
 
 		 268 aa  47  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  32.2 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  26.16 
 
 		 292 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  26.16 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  26.16 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  34.09 
 
 		 569 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  28.57 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  32.63 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  29.93 
 
 		 312 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  30.54 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  29.56 
 
 		 280 aa  46.2  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  28.67 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  28.28 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  30.37 
 
 		 295 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  29.66 
 
 		 290 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  29.94 
 
 		 323 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  24.06 
 
 		 300 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  31.93 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  29.66 
 
 		 290 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  30.08 
 
 		 269 aa  44.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  29.58 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  29.73 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1094  parB-like partition proteins  45.9 
 
 		 321 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0765173  hitchhiker  0.00022246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  29.8 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  32.76 
 
 		 299 aa  44.3  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  32.76 
 
 		 299 aa  44.3  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  26.16 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  28.67 
 
 		 328 aa  44.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  25.58 
 
 		 292 aa  44.3  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 274 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  30.23 
 
 		 298 aa  43.9  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  32.46 
 
 		 310 aa  43.5  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  28.93 
 
 		 298 aa  43.9  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  28.93 
 
 		 298 aa  43.9  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  28.93 
 
 		 298 aa  43.9  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  26.82 
 
 		 304 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  25.62 
 
 		 615 aa  43.5  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>