More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1410 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1719  parB family protein  95.43 
 
 		 417 aa  781    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1410  parB-like partition protein  100 
 
 		 412 aa  822    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.156859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0272  parB-like partition protein  99.03 
 
 		 412 aa  813    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  36.65 
 
 		 280 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  38.56 
 
 		 288 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  36.42 
 
 		 315 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  33.18 
 
 		 279 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  36.15 
 
 		 285 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  37.87 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  36.94 
 
 		 285 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  35.85 
 
 		 289 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  37.34 
 
 		 286 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  32.35 
 
 		 287 aa  93.6  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  35.47 
 
 		 299 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  37.66 
 
 		 298 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  37.34 
 
 		 293 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  36.31 
 
 		 295 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  35.19 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  35.19 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  35.19 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  35.62 
 
 		 256 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  35.19 
 
 		 283 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  35.19 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  33.33 
 
 		 281 aa  90.9  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  36.13 
 
 		 278 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  36.13 
 
 		 278 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  33.13 
 
 		 283 aa  90.5  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 322 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  35.68 
 
 		 298 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  38.31 
 
 		 296 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  35.19 
 
 		 283 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  34.57 
 
 		 283 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  35.19 
 
 		 283 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  31.36 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  35.24 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  33.77 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  36.91 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  33.19 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  35 
 
 		 256 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  35.24 
 
 		 298 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  38.75 
 
 		 294 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  36.31 
 
 		 255 aa  87.4  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  32.5 
 
 		 292 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  31.82 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  33.66 
 
 		 294 aa  86.7  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  34.73 
 
 		 289 aa  86.3  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  27.69 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  33.72 
 
 		 301 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  35.85 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  38.76 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  34.76 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  33.96 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  34.39 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  37.34 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  35.22 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  37.97 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  37.58 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  33.72 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  28.93 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  32.49 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  35.48 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  31.58 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  31.58 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  36.91 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  31.29 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  37.2 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  34.64 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  34.94 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  38.81 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  34.73 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  29.37 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  36.25 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  35.46 
 
 		 295 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  36.71 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  36.75 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  36.48 
 
 		 529 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  36.42 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  34.59 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  32.62 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  34.18 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  35.06 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  37.11 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  35.03 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  35.44 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  31.94 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  34.81 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  38.03 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  31.42 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  33.53 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  33.53 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  36.24 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  33.53 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  33.53 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  33.77 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>