29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9009 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_9009  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 575 aa  1161    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.133491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0940  hypothetical protein  36.44 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1320  nuclease  26.73 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4332  ParB family protein  25.58 
 
 		 451 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4642  parB-like partition protein  25.32 
 
 		 451 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5536  nuclease  31.23 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021516  hitchhiker  0.0000306668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  25.09 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  34.69 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  30.07 
 
 		 314 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  29.09 
 
 		 272 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  29.33 
 
 		 309 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  27.42 
 
 		 279 aa  47  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  26.54 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  29.51 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  27.85 
 
 		 326 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  29.88 
 
 		 662 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  29.24 
 
 		 344 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  31.78 
 
 		 293 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  28.03 
 
 		 319 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  30.2 
 
 		 274 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  30.67 
 
 		 294 aa  44.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  31.3 
 
 		 296 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  29.32 
 
 		 268 aa  44.3  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  27.61 
 
 		 310 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  25.93 
 
 		 336 aa  43.9  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  29.69 
 
 		 318 aa  43.9  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  26.45 
 
 		 295 aa  43.5  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  30.88 
 
 		 294 aa  43.5  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  27.33 
 
 		 312 aa  43.5  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>