33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0528 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  100 
 
 		 319 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  56.89 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  51.74 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  51.74 
 
 		 305 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  44.64 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  45.26 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  45.26 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  44.95 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  43.15 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  42.21 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  39.45 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  41.3 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  36.64 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  34.58 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  35.71 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  36.05 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  31.82 
 
 		 597 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  36.52 
 
 		 596 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  31.06 
 
 		 612 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  28.65 
 
 		 579 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  34.78 
 
 		 559 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  31.25 
 
 		 557 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  29.75 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  30.33 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  26.92 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  33.05 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9009  ParB domain protein nuclease  28.03 
 
 		 575 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.133491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  29.84 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  31.72 
 
 		 571 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  38.46 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  29.51 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  29.51 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>