36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3814 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  99.02 
 
 		 305 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  51.74 
 
 		 319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  50.53 
 
 		 322 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  47.06 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  47.06 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  46.83 
 
 		 292 aa  275  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  43.54 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  45.23 
 
 		 292 aa  258  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  45.49 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  42.31 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  41.61 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  38.11 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  37.06 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  37.06 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  37.06 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  34.56 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  33.33 
 
 		 596 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  27.69 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  33.63 
 
 		 597 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  29.1 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  30.95 
 
 		 571 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  31.82 
 
 		 557 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  33.64 
 
 		 579 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  30.18 
 
 		 785 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  34.51 
 
 		 559 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  29.1 
 
 		 612 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  27.21 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  25.62 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  22.71 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  27.74 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4477  plasmid partitioning protein  30.91 
 
 		 560 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0558103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  29.2 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  26.92 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1162  ParB-like nuclease domain-containing protein  26.55 
 
 		 542 aa  43.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  27.52 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>