37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2984 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  79.11 
 
 		 292 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  79.11 
 
 		 292 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  66.1 
 
 		 300 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  64.04 
 
 		 292 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  45.23 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  45.23 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  45.14 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  44.95 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  45.61 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  43.11 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  43.46 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  31.83 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  31.05 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  31.14 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  31.14 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  31.14 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  29.48 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  26.82 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  24.23 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  26.01 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  26.44 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  26.96 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  26.44 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  25.77 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  26.55 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  28.23 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  29.2 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  23.96 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  27.55 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  28.47 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  45.1 
 
 		 477 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  27.71 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  26.61 
 
 		 329 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  29.01 
 
 		 401 aa  42.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>