23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0832 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  89.19 
 
 		 297 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  41.7 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  41.61 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  39.45 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  43.23 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  43.46 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  40.62 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  41.99 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  41.99 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  42.76 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  35.66 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  34.01 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  36.84 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  36.09 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  36.3 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  30.36 
 
 		 597 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  29.36 
 
 		 579 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  27.97 
 
 		 612 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  28.57 
 
 		 559 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1026  ParB-like nuclease domain-containing protein  27.36 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  29.46 
 
 		 596 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>