45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2908 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  100 
 
 		 298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  99.33 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  99.33 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  90.2 
 
 		 297 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  44.75 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  37.06 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  37.06 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  36.05 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  36.62 
 
 		 322 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  35.54 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  36.09 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  33.33 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  31.64 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  31.64 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  30.51 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  31.14 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  31.77 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  27.66 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  31 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2543  parB-like partition protein  25.83 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  30.86 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  24.83 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  26.95 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  29.63 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  25.48 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  31 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  29.91 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  28.35 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  28.47 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  29.25 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  24.36 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  24.36 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  29.27 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  28.69 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  27.87 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  28.69 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  22.63 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  25.62 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  25 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  27.54 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  30.48 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  30.48 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0021  ParB family protein  30.19 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  30.16 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>