55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2890 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  100 
 
 
297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  90.2 
 
 
298 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  90.2 
 
 
298 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  90.2 
 
 
298 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  43.79 
 
 
294 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  38.11 
 
 
305 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  38.11 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  36.64 
 
 
319 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  35.84 
 
 
297 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  37.32 
 
 
322 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  34.01 
 
 
297 aa  185  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  32.87 
 
 
292 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  31.14 
 
 
292 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  31.14 
 
 
292 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  31.34 
 
 
297 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  31.83 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  30.98 
 
 
300 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  24.86 
 
 
268 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  32 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  32 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  23.71 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  30.86 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  27.66 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  26.75 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  26.14 
 
 
291 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  30 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  26.52 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  25.64 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  23.81 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  28.47 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  23.81 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  26.52 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  30.86 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  26.52 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  26.52 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  29.27 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  25.64 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  26.52 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  25.76 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  25.16 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  26.52 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  25.76 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  26.95 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  28.57 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3738  parB-like partition proteins  27.18 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.412058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  29.19 
 
 
411 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  28.07 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  25.76 
 
 
290 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  26.98 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  33.77 
 
 
272 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  28.32 
 
 
292 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2543  parB-like partition protein  25 
 
 
358 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  25.62 
 
 
355 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  26.32 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  28.69 
 
 
283 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>