36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1190 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  79.11 
 
 		 292 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  67.81 
 
 		 300 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  64.38 
 
 		 292 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  47.24 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  47.06 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  48.19 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  45.26 
 
 		 319 aa  245  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  48.53 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  40.93 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  41.99 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  33.46 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  31.64 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  31.14 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  31.64 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  31.64 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  27.12 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  27.12 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  28.12 
 
 		 282 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  37.65 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  26.76 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  23.96 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  25.45 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  24.16 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  24.22 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  25.45 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  27.14 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  28.87 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  27.14 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  24.66 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  33.33 
 
 		 421 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  24.78 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  26.95 
 
 		 401 aa  42.7  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  26.96 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  24.4 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>