42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0026 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  67.81 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  67.81 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  66.1 
 
 		 292 aa  417  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  65.19 
 
 		 292 aa  401  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  44.41 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  43.54 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  47.55 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  47.72 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  43.15 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  43.23 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  42.11 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  31.99 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  30.98 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  31.77 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  31.77 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  31.77 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  27.45 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  26.98 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  26.91 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  26.91 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  25.52 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.43 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  26.9 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  24.87 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  24.87 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  24.76 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  24.58 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  25.71 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  26.26 
 
 		 401 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  25.26 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1094  parB-like partition proteins  32.39 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0765173  hitchhiker  0.00022246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  24.85 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  24.05 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  30.86 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  24.76 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  24.74 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  24.07 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  30.12 
 
 		 417 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  24.35 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  24.35 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  26.56 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>