27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1404 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  100 
 
 		 297 aa  608  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  89.19 
 
 		 297 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  42.21 
 
 		 319 aa  231  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  42.31 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  42.4 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  43.11 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  44.88 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  40.62 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  40.93 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  40.93 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  42.11 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  39.27 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  35.84 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  35.54 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  35.54 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  35.54 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  37.41 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  30.08 
 
 		 597 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  28.24 
 
 		 579 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  27.69 
 
 		 612 aa  49.3  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  29.37 
 
 		 596 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2368  nuclease  35 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.712481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  26.43 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  26.9 
 
 		 559 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  27.48 
 
 		 459 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1026  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.3 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  25.37 
 
 		 557 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>