122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2368 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2368  nuclease  100 
 
 		 331 aa  656    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.712481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1262  hypothetical protein  26.96 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  30.72 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  26.26 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  31.33 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  31.58 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  26.6 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  28.68 
 
 		 612 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  27.06 
 
 		 571 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  24.67 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  32.98 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  30.65 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  25 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  35.71 
 
 		 288 aa  49.3  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  30.26 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  28.97 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  30.82 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2908  hypothetical protein  24.62 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  27.49 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  28.78 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  24.68 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  29.79 
 
 		 579 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  27.46 
 
 		 587 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  27.63 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3690  nuclease  37 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  26.29 
 
 		 559 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2844  parB-like partition protein  30.14 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  27.27 
 
 		 557 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  25.31 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  30.37 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  27.12 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  26.88 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  26.71 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  28.98 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  30.25 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  25.13 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  25.98 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  28.39 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  25.13 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 615 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  31.91 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  30.97 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4477  plasmid partitioning protein  25.71 
 
 		 560 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0558103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  26.51 
 
 		 261 aa  47  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1936  hypothetical protein  24.57 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  29.75 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  35 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1026  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.46 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  27.04 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  27.14 
 
 		 597 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  26.42 
 
 		 289 aa  46.2  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  27.18 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  28 
 
 		 290 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  28.81 
 
 		 323 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  27.27 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  35.63 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4296  parB-like partition protein  29.61 
 
 		 624 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  1.40492e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  28.06 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  30.54 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  29.03 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  34.38 
 
 		 583 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  32.42 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  28 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  29.33 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  25.48 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  29.33 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  24.88 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  25.33 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  25.33 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0123  ParB family protein  28.03 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  31.36 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  27.05 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  24.89 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  29.32 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  29.33 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0177  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000490694  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  24.22 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  25.99 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  25.99 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  32.08 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  29.75 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  27.75 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  27.59 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  29.76 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  30.51 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  27.21 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3709  ParB domain protein nuclease  35.24 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  25.68 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  31.48 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  26.86 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  27.98 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  30.29 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  27.78 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  27.78 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  24.87 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  24.29 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>