46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1562 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  919    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  34.38 
 
 		 445 aa  272  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  36.64 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  34.04 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  33.73 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  33.17 
 
 		 427 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  34.63 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  33.09 
 
 		 407 aa  229  7e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  37.94 
 
 		 427 aa  226  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  35.73 
 
 		 424 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.34 
 
 		 425 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  34.81 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  35.92 
 
 		 424 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  31.28 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  35.96 
 
 		 424 aa  216  9e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  31.91 
 
 		 409 aa  211  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  31.16 
 
 		 413 aa  206  9e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  32.3 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  36.36 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  32.53 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  29.65 
 
 		 420 aa  199  7.999999999999999e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  27.08 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  27.73 
 
 		 460 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  31.7 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  29.56 
 
 		 407 aa  171  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  30.94 
 
 		 415 aa  169  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  25.58 
 
 		 481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  31.71 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  24.83 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  23.49 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  24.84 
 
 		 296 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  24 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  26.85 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  28.29 
 
 		 250 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  23.53 
 
 		 245 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  26 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  23.53 
 
 		 245 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  27.33 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  25.5 
 
 		 301 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  24 
 
 		 232 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  21.09 
 
 		 297 aa  46.6  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  22.5 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  22.37 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  22.29 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  23.84 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  26.28 
 
 		 246 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>