36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1170 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  75.36 
 
 
415 aa  643    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  840    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  68.84 
 
 
413 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  67.96 
 
 
432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  38.5 
 
 
407 aa  222  9e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  33.26 
 
 
445 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  31.18 
 
 
450 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  31.19 
 
 
443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  35.08 
 
 
417 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  30.64 
 
 
424 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  29.69 
 
 
424 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  30.4 
 
 
424 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  35.22 
 
 
407 aa  167  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  35.46 
 
 
415 aa  167  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  32.93 
 
 
409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  33.18 
 
 
428 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  32.27 
 
 
446 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  35.51 
 
 
415 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  29.12 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  35.01 
 
 
427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  27.99 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  30.21 
 
 
431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.68 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  31.35 
 
 
423 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  31.57 
 
 
431 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  31.74 
 
 
420 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  33.83 
 
 
460 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  29.14 
 
 
481 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  29.38 
 
 
246 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  28.75 
 
 
246 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  28.48 
 
 
301 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  28.76 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  28.29 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  27.85 
 
 
301 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  27.85 
 
 
301 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>