26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2138 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  647    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  72.01 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  69.18 
 
 
318 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  60 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  31.23 
 
 
301 aa  125  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  32.28 
 
 
301 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  31.93 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  31.93 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  30.2 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  29.89 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  32.46 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  29.33 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0229  hypothetical protein  34.09 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  32.49 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  29.78 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  28 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  31.55 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0595  hypothetical protein  33.33 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2291  hypothetical protein  25.28 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  25.35 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  26.58 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  26.06 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  31.58 
 
 
415 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  21.77 
 
 
450 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  30.92 
 
 
245 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  43.66 
 
 
432 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>