31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0604 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  894    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  34.38 
 
 
450 aa  259  7e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  34.6 
 
 
446 aa  246  8e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  36.93 
 
 
417 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  33.41 
 
 
428 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  35.38 
 
 
409 aa  209  7e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  33.56 
 
 
443 aa  206  6e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  35.89 
 
 
427 aa  203  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  34.62 
 
 
407 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  34.2 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  30.91 
 
 
431 aa  200  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  34.8 
 
 
431 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33.26 
 
 
425 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  35.33 
 
 
413 aa  189  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  29.67 
 
 
424 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  28.94 
 
 
427 aa  187  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  33.33 
 
 
415 aa  186  8e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  33.49 
 
 
420 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  28.5 
 
 
424 aa  183  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  35.07 
 
 
415 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  34.58 
 
 
415 aa  177  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  28.5 
 
 
424 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  31.85 
 
 
415 aa  176  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  32.72 
 
 
432 aa  173  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  30.02 
 
 
460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  27.71 
 
 
417 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  30.21 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  32.85 
 
 
481 aa  136  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  21.33 
 
 
889 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  32.56 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  20.96 
 
 
877 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>