31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0275 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  849    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  92.45 
 
 
424 aa  790    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  73.35 
 
 
427 aa  647    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  92.22 
 
 
424 aa  795    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  65.31 
 
 
417 aa  531  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  37.77 
 
 
417 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  39.16 
 
 
428 aa  310  4e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  42.92 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  36.67 
 
 
427 aa  293  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  38 
 
 
431 aa  292  8e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  37.38 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  36.6 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  37.14 
 
 
415 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  31.76 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  35.38 
 
 
415 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  31.15 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  30.88 
 
 
431 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  30.24 
 
 
460 aa  213  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  35.92 
 
 
450 aa  210  4e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  28.33 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  28.5 
 
 
445 aa  183  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  31.84 
 
 
409 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  32.78 
 
 
443 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  31.11 
 
 
413 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  29.29 
 
 
415 aa  154  4e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  27.96 
 
 
415 aa  147  5e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  26.79 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  29.07 
 
 
407 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  28.39 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  24.84 
 
 
232 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>