35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2319 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  885    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  59.03 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  47.79 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  48.08 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  45.92 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  43.56 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  45.19 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  42.66 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  45.19 
 
 		 415 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  41.81 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  40.79 
 
 		 420 aa  325  8.000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  43.36 
 
 		 415 aa  324  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  40.56 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  39.16 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  39.39 
 
 		 424 aa  308  9e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  38.55 
 
 		 427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  39.68 
 
 		 417 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  38.02 
 
 		 481 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  38.77 
 
 		 446 aa  279  7e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  36.64 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  33.57 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  32.81 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  33.41 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  32.17 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  31.76 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  31.34 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  38.41 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  30.33 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  30.12 
 
 		 246 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  33.58 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  26.67 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  27.56 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  28.31 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  28.4 
 
 		 247 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  24.16 
 
 		 297 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>