35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1790 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  100 
 
 
423 aa  841    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  67.13 
 
 
431 aa  558  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  63.12 
 
 
420 aa  503  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  60.43 
 
 
460 aa  500  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  55.67 
 
 
481 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  45.92 
 
 
428 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  44.91 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  46.99 
 
 
407 aa  319  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  47.52 
 
 
415 aa  319  7e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  45.9 
 
 
417 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  46.38 
 
 
427 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  42.65 
 
 
415 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  42.37 
 
 
425 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  34.42 
 
 
427 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  33.26 
 
 
424 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  35.7 
 
 
446 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  32.32 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  31.15 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  30.5 
 
 
417 aa  218  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  31.28 
 
 
450 aa  207  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  34.2 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  29.84 
 
 
443 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  31.92 
 
 
409 aa  163  7e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  31.34 
 
 
413 aa  142  8e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  29.93 
 
 
415 aa  116  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  26.94 
 
 
407 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  33.58 
 
 
415 aa  104  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  28.44 
 
 
432 aa  103  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  28.75 
 
 
245 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 
1045 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  28.39 
 
 
250 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  26.29 
 
 
244 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 
1045 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  30.77 
 
 
246 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  28.12 
 
 
245 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>