30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0989 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  92.22 
 
 
424 aa  795    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  90.09 
 
 
424 aa  784    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  72.17 
 
 
427 aa  645    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  855    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  63.64 
 
 
417 aa  527  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  42.56 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  39.39 
 
 
428 aa  308  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  37.53 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  38.57 
 
 
427 aa  300  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  38.42 
 
 
407 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  38 
 
 
431 aa  289  8e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  36.6 
 
 
425 aa  263  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  38.1 
 
 
415 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  32.71 
 
 
420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  35.14 
 
 
415 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  33.26 
 
 
423 aa  246  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  31.81 
 
 
431 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  30.64 
 
 
460 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  35.73 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  32.55 
 
 
443 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  29.67 
 
 
445 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  28.42 
 
 
481 aa  187  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  30.59 
 
 
409 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  32.39 
 
 
413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  29.76 
 
 
415 aa  153  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  29.03 
 
 
415 aa  152  7e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  27.03 
 
 
432 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  28.2 
 
 
407 aa  116  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  30.32 
 
 
318 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  25.16 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>