35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2547 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 		 425 aa  883    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  56.58 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  55.11 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  49.52 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  49.75 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  47.91 
 
 		 417 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  43.56 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  41.9 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  40 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  42.51 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  38.31 
 
 		 460 aa  285  7e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  42.37 
 
 		 423 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  37.35 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  36.6 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  36.6 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  36.12 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  37.05 
 
 		 481 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  36.6 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  35.46 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  31.34 
 
 		 450 aa  209  6e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  33.26 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  30.71 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  28.7 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  31.01 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  31.07 
 
 		 413 aa  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  32.62 
 
 		 432 aa  126  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  37.83 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  30.97 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  34.62 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  30.56 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  28.97 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  30.61 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  27.59 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  28.28 
 
 		 301 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  24.49 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>