28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0272 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  100 
 
 		 481 aa  948    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  56.26 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  55.67 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  55.72 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  52.25 
 
 		 460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  38.43 
 
 		 428 aa  312  9e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  37.58 
 
 		 431 aa  291  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  41.4 
 
 		 427 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  39.15 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  40.04 
 
 		 417 aa  279  7e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  37.47 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  40.04 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  36.73 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  30.58 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  28.63 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  28.54 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  28.69 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  28.54 
 
 		 427 aa  196  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  30.95 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  25.79 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  33.06 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  28.09 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  26.21 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  28.84 
 
 		 413 aa  113  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  26.28 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  29.02 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  33.24 
 
 		 415 aa  99  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  29.72 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>