34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1810 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  100 
 
 
431 aa  897    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  59.03 
 
 
428 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  45.6 
 
 
417 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  44.91 
 
 
423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  45.19 
 
 
407 aa  352  8e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  41.75 
 
 
431 aa  332  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  41.85 
 
 
460 aa  330  3e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  42.89 
 
 
415 aa  329  7e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  44.1 
 
 
427 aa  327  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  42.26 
 
 
420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40 
 
 
425 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  38.32 
 
 
424 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  39 
 
 
415 aa  293  5e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  38 
 
 
424 aa  292  8e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  38 
 
 
424 aa  289  8e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  38.91 
 
 
446 aa  279  8e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  37.47 
 
 
427 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  36.56 
 
 
417 aa  271  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  37.58 
 
 
481 aa  270  4e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  33.73 
 
 
450 aa  234  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  34.35 
 
 
409 aa  224  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  30.3 
 
 
443 aa  200  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  30.91 
 
 
445 aa  200  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  30.81 
 
 
413 aa  152  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  29.33 
 
 
407 aa  143  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  28.07 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  32.6 
 
 
415 aa  113  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  26.5 
 
 
432 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  32.92 
 
 
246 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  30.43 
 
 
246 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  29.94 
 
 
247 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  29.34 
 
 
251 aa  46.6  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  30.86 
 
 
246 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  29.11 
 
 
251 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>