31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3672 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  62.35 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  60.82 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  60 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  60.82 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  61.79 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  59.92 
 
 		 252 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  60.41 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  60.41 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  65.99 
 
 		 150 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  46.06 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  48.79 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  43.32 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  45.82 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  43.27 
 
 		 244 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  43.09 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  44.13 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  36.71 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  35.39 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  37.23 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  39.02 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  32.66 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  31.13 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  36.88 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  32.66 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0094  hypothetical protein  47.13 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  33.47 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  29.34 
 
 		 431 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  31.37 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>