31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4251 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  96.73 
 
 
245 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  97.14 
 
 
245 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  84.49 
 
 
245 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  84.08 
 
 
245 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  97.28 
 
 
150 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  60.32 
 
 
252 aa  295  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  60 
 
 
251 aa  295  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  60.98 
 
 
250 aa  292  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  58.54 
 
 
251 aa  285  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  53.47 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  45.12 
 
 
246 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  41.49 
 
 
242 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  41.39 
 
 
244 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  42.97 
 
 
246 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  41.87 
 
 
246 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  40.55 
 
 
246 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0094  hypothetical protein  96.59 
 
 
88 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  42.59 
 
 
219 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  36.21 
 
 
243 aa  122  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  37.66 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  34.71 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  35.96 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  26.59 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  32.8 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  28.45 
 
 
265 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  34.38 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  27.78 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  30.61 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  31.01 
 
 
301 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  24.02 
 
 
450 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>