29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4084 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  59.92 
 
 
250 aa  298  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  60.32 
 
 
245 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  59.13 
 
 
251 aa  295  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  60.32 
 
 
245 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  59.92 
 
 
251 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  59.92 
 
 
245 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  59.13 
 
 
245 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  58.33 
 
 
245 aa  288  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  50.79 
 
 
247 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  43.53 
 
 
246 aa  201  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  61.84 
 
 
150 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  41.94 
 
 
242 aa  178  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  42.75 
 
 
246 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  42.35 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  44.75 
 
 
219 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  40.16 
 
 
246 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  36 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  44.38 
 
 
232 aa  115  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  35.98 
 
 
234 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  40.59 
 
 
232 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  31.5 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  31.2 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  30 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  28.04 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0094  hypothetical protein  53.93 
 
 
88 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  32 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  36 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>