34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0513 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  42.92 
 
 
232 aa  199  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  44.44 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  38.27 
 
 
197 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  42.78 
 
 
243 aa  125  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  36.32 
 
 
244 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  35.04 
 
 
242 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  35.11 
 
 
246 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  35.12 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  36.71 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  35.87 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  34.71 
 
 
245 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  34.71 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  36.16 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  32.77 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  35.5 
 
 
245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  35.06 
 
 
245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  41.82 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  34.75 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  35.74 
 
 
251 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  34.51 
 
 
246 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  34.45 
 
 
219 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  38.58 
 
 
247 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  42.26 
 
 
246 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  40.59 
 
 
252 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  36.77 
 
 
150 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  30.09 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  26.32 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  24.84 
 
 
301 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  25.49 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  24.18 
 
 
301 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  23.53 
 
 
301 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  24 
 
 
450 aa  47  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  32.45 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>