36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1532 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  57.89 
 
 
246 aa  292  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  58.87 
 
 
246 aa  280  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  52.23 
 
 
246 aa  251  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  49.19 
 
 
242 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  46.75 
 
 
244 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  53.46 
 
 
219 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  48.79 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  43.5 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  40.08 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  44.27 
 
 
245 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  43.09 
 
 
245 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  43.5 
 
 
245 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  45.38 
 
 
247 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  43.03 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  42.97 
 
 
245 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  42.75 
 
 
252 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  42.68 
 
 
250 aa  175  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  36.84 
 
 
245 aa  148  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  49.32 
 
 
150 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  40.69 
 
 
232 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  38.7 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  36.65 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  40.2 
 
 
234 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  34.51 
 
 
232 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  38.18 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  32.98 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  34.31 
 
 
361 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  30.67 
 
 
413 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  30.86 
 
 
431 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  28.31 
 
 
428 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  29.01 
 
 
415 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  26.77 
 
 
432 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  30.19 
 
 
415 aa  43.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  25.32 
 
 
306 aa  42.7  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>