35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0972 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  722    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  55.93 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  56.09 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  49.57 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2291  hypothetical protein  48.71 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  26.71 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  27.46 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  28.72 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  26.15 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  24.33 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  26.99 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  23.4 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  23.4 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  32.13 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  22.35 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  24.34 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  27.78 
 
 		 303 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  25.98 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  33.56 
 
 		 413 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  53.1  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  28.47 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  31.37 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  32.43 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  29.94 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  29.61 
 
 		 244 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  27.11 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  31.39 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0595  hypothetical protein  25.15 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  29.03 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 234 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  29.03 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0229  hypothetical protein  31.61 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  30 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  29.33 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>