20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0480 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  100 
 
 		 375 aa  768    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  49.86 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  49.31 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  49.57 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2291  hypothetical protein  45.45 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  26.2 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  27.74 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  25.61 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  25.35 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  27.67 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  28.3 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  28.3 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  28.03 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  29.65 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  32.03 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  29.27 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  26.24 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  26.05 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  29.73 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  23.68 
 
 		 302 aa  42.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>