38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1994 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  739    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  56.35 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  55.93 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  49.86 
 
 		 375 aa  345  6e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2291  hypothetical protein  49.86 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  26.87 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  24.81 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  25.26 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  25.83 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  24.06 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  23.69 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  26.91 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  32.94 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  26.58 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  24.81 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  24.03 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  32 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.21 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  24.34 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  34.84 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  38.95 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  26.38 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  27.91 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  25.62 
 
 		 450 aa  53.5  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  31.21 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  24.09 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  29.63 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  36.94 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0595  hypothetical protein  25.27 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.183466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  26.59 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  28.48 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  33.13 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  31.76 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  30.67 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  30.72 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  32.56 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  29.53 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  30.97 
 
 		 460 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>