36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0594 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  693    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  72.01 
 
 
318 aa  457  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  71.07 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  59.68 
 
 
318 aa  363  3e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  32.4 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  32.44 
 
 
301 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  32.44 
 
 
301 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  32.44 
 
 
301 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  29.33 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  32.43 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  31.1 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  29.51 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  30.67 
 
 
297 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  29.17 
 
 
296 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  32.61 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  25.36 
 
 
368 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0595  hypothetical protein  28.22 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0229  hypothetical protein  30.84 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  26.24 
 
 
375 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  26.64 
 
 
361 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  22.77 
 
 
368 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2291  hypothetical protein  22.53 
 
 
364 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  23.49 
 
 
450 aa  49.7  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  31.79 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  26.62 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  27.1 
 
 
427 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  30 
 
 
413 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  29.45 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  25.16 
 
 
424 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  25 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  24.52 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  25.95 
 
 
417 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  28.95 
 
 
246 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  29.66 
 
 
417 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  30 
 
 
444 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  28.77 
 
 
431 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>