34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0629 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  71.07 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  69.18 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  60.44 
 
 
318 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  34.49 
 
 
301 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  35.19 
 
 
301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  35.19 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  35.19 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  31.93 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  33.11 
 
 
302 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  30.96 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0229  hypothetical protein  30.93 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  31.53 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  35.45 
 
 
296 aa  96.3  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  30.85 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  29.52 
 
 
368 aa  89.7  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  31.65 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0595  hypothetical protein  29.83 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2291  hypothetical protein  25.3 
 
 
364 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  27.17 
 
 
375 aa  62.4  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  25.1 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  28.72 
 
 
361 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  30.32 
 
 
424 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  30.26 
 
 
431 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  29.68 
 
 
424 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  33.55 
 
 
415 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  28.97 
 
 
415 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.56 
 
 
425 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  22.37 
 
 
450 aa  46.6  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  28.39 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  30.2 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  32.35 
 
 
415 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  26.28 
 
 
427 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  31.94 
 
 
219 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>