30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2348 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  863    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  64.2 
 
 		 407 aa  525  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  66.58 
 
 		 415 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  55.11 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  52.61 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  49.88 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  45.19 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  44.1 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  44.39 
 
 		 431 aa  315  8e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  46.38 
 
 		 423 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  44.63 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  38.57 
 
 		 424 aa  300  5e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  37.86 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  36.67 
 
 		 424 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  41.29 
 
 		 460 aa  286  5e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  38.28 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  36.28 
 
 		 427 aa  280  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  41.19 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  35.15 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  33.17 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  35.18 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  35.89 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  29.38 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  37.2 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  31.18 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  40.78 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  33.49 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  34.54 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  38.95 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  29.17 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>