35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0159 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  859    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  55.77 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  53.22 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  52.61 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  49.75 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  43.36 
 
 		 428 aa  324  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  41.61 
 
 		 417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  42.65 
 
 		 431 aa  302  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  39 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  42.65 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  39.34 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  38.8 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  36.94 
 
 		 427 aa  253  6e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  35.14 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  36.08 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  35.38 
 
 		 424 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  35.88 
 
 		 481 aa  238  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  34.52 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  34.58 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  32.37 
 
 		 450 aa  196  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 445 aa  186  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  33.02 
 
 		 409 aa  186  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  35.19 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  30.4 
 
 		 443 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  32.77 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  36.1 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  34.75 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  34.92 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  27.85 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  34.88 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  26.62 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  27.4 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  28.21 
 
 		 246 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1086  hypothetical protein  35 
 
 		 209 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  27.59 
 
 		 297 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>