32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2622 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  58.87 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  53.04 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  49.6 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  52.31 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  47.77 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  46.96 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  48 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  45.82 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  43.6 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  44.35 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  43.78 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  40.55 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  40.55 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  40.94 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  42.35 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  41.77 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  35.48 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  39.11 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  45.03 
 
 		 150 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  39.3 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  32.93 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  42.13 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  37.5 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  42.26 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  38.55 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  39.06 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  34.69 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  32.92 
 
 		 431 aa  52  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  30.12 
 
 		 428 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  28.95 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  28.21 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>