29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0606 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  37.04 
 
 
242 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  40.09 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  39.65 
 
 
245 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  34.55 
 
 
246 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  36.21 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  36.21 
 
 
245 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  36.21 
 
 
245 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  38.7 
 
 
246 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  37.55 
 
 
251 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  35.39 
 
 
251 aa  141  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  36.96 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  32.93 
 
 
246 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  37.44 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  36.16 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  34.71 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  36.18 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  31.2 
 
 
252 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  37.16 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  39.58 
 
 
150 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  30.22 
 
 
246 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  38.92 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  29.82 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  36.69 
 
 
232 aa  85.9  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  29.06 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  28.81 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  30.95 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  32.14 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  28.4 
 
 
375 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>