28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2484 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  510  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  44.13 
 
 
246 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  40.65 
 
 
242 aa  191  9e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  40.08 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  36.18 
 
 
244 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  35.48 
 
 
246 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  34.82 
 
 
246 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  33.03 
 
 
219 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  27.38 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  27.38 
 
 
245 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  26.59 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  27.68 
 
 
245 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  29.78 
 
 
247 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  26.83 
 
 
251 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  26.02 
 
 
250 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  28.04 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  30.22 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  25.3 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  26.32 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  28.38 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  29.15 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  22.52 
 
 
150 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  30 
 
 
197 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  29.17 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  24.04 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0094  hypothetical protein  27.78 
 
 
88 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>