31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0135 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  70.52 
 
 		 250 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  61.79 
 
 		 245 aa  299  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  62.35 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  61.38 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  59.13 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  59.35 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  58.94 
 
 		 245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  58.54 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  54.07 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  64.63 
 
 		 150 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  43.27 
 
 		 244 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  44.53 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  43.5 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  43.6 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  41.74 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  46.3 
 
 		 219 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  40.89 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  37.55 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  36.8 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  33.73 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  39.49 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  35.74 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  26.83 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  31.78 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  35.9 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  35.2 
 
 		 197 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  40.74 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0094  hypothetical protein  47.19 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  23.84 
 
 		 450 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  29.11 
 
 		 431 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>